云南農(nóng)業(yè)大學總共有73個專業(yè)。

云南農(nóng)業(yè)大學本科專業(yè)有65個：電氣工程及其自動化、建筑環(huán)境與設備工程、風景園林、農(nóng)業(yè)水利工程、森林資源保護與游憩、土木工程（高職本科）、草業(yè)科學、農(nóng)業(yè)建筑環(huán)境與能源工程、給排水科學與工程、農(nóng)業(yè)機械化及其自動化、建筑環(huán)境與能源應用工程、食品質量與安全、煙草、種子科學與工程、食品科學與工程、中草藥栽培與鑒定、茶學、蠶學、食品科學與工程（蜂學及蜂產(chǎn)品加工方向）、茶學（茶藝茶道方向）、機械設計制造及其自動化、車輛工程、農(nóng)學、水利水電工程、土木工程、植物保護、園林（高爾夫球場管理方向）、電子信息工程、網(wǎng)絡工程、水土保持與荒漠化防治、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、計算機科學與技術、動物科學、園林、動物科學（飼料科學與工程方向）、動物醫(yī)學、工業(yè)工程、秘書學、動物醫(yī)學（動物檢疫方向）、數(shù)學與應用數(shù)學、信息管理與信息系統(tǒng)、水產(chǎn)養(yǎng)殖學、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展、資源環(huán)境與城市規(guī)劃管理、園藝、農(nóng)林經(jīng)濟管理、園藝（中荷交流項目）、農(nóng)林經(jīng)濟管理（特有民族班）、環(huán)境科學、設施農(nóng)業(yè)科學與工程、人文地理與城鄉(xiāng)規(guī)劃、電子商務、蜂學、生物技術、土地資源管理、森林保護與游憩、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理、社會工作、經(jīng)濟學、動植物檢疫(植物檢疫方向)、旅游管理、應用化學、社會體育指導與管理、英語、體育教育。

云南農(nóng)業(yè)大學其他專業(yè)有8個：能源與動力工程、越南語、公共事業(yè)管理、工程管理、工程造價、建筑學、環(huán)境工程、行政管理。